Dos dois meses no clube, Juninho passou quase um mês se recuperando de um edema muscular na coxa direita. Ele deixou o gramado no dia 12 de fevereiro, logo no início do clássico contra o Botafogo, e retornou somente no dia 8 de março, na semifinal contra o Vasco, quando atuou por pouco mais de 17 minutos. O controle de minutagem faz parte do plano de retorno do atleta após a passagem pelo departamento médico.